Моделирование возникновения и роста раковых образований при коллективном взаимодействии клеток живой ткани,обменивающихся химическими и механическими сигналами

Авторы

  • Д.А. Брацун Пермский национальный исследовательский политехнический университет
  • А.П. Захаров Пермский государственный гуманитарно-педагогический университет
  • И.В. Красняков Пермский национальный исследовательский политехнический университет
  • А.В. Люшнин Пермский государственный гуманитарно-педагогический университет
  • Д.В. Меркурьев Пермский государственный медицинский университет им. академика Е.А. Вагнера

DOI:

Ключевые слова:

математическое моделирование, карцинома, циркадианные ритмы, генная регуляция, сложные системы

Аннотация

Предложена хемомеханическая модель возникновения и развития раковых образований в ткани эпителия. Модель включает индивидуальную динамику каждой клетки, которая зависит от изменения ее формы и объема, положения в ткани, интеркаляции, а также способности к делению. Для описания эволюции опухоли вводится два класса клеток, отличающихся набором химических и механических параметров. В работе предполагается, что трансформация здоровой клетки в раковую происходит из-за локального сбоя пространственной синхронизации циркадианных ритмов, которые, в свою очередь, вызываются процессами транскрипции/трансляции в клетках эпителия и обменом между ними белковыми сигналами. В калибровке модели были использованы данные о морфологии клеток эпителия. Применены как детерминистское, так и стохастическое описание системы. Численное изучение эволюционной динамики модели выявило различные белковые паттерны, часть из которых провоцирует возникновение опухоли. Вариации параметров в ходе расчета позволили воспроизвести различные типы карциномы как инвазивного, так и неинвазивного типа. Разработанная модель может быть использована для детального изучения влияния тагетированных лекарств на клетки опухоли.

Поддерживающие организации
Работа выполнена при финансовой поддержке РФФИ и Правительства Пермского края (грант № 14-01-96022) и Министерства образования и науки Пермского края (грант С-26/004.4).

Биографии авторов

  • Д.А. Брацун, Пермский национальный исследовательский политехнический университет
    доктор физико-математических наук, заведующий кафедрой прикладной физики
  • А.П. Захаров, Пермский государственный гуманитарно-педагогический университет
    кандидат физико-математических наук, старший научный сотрудник
  • И.В. Красняков, Пермский национальный исследовательский политехнический университет
    магистрант
  • А.В. Люшнин, Пермский государственный гуманитарно-педагогический университет
    кандидат физико-математических наук, доцент кафедры теоретической физики и компьютерного моделирования
  • Д.В. Меркурьев, Пермский государственный медицинский университет им. академика Е.А. Вагнера
    кандидат медицинских наук, доцент кафедры госпитальной педиатрии

Библиографические ссылки

  1. Bratsun D.A., Merkuriev D.V., Zakharov A.P., Pismen L.M. Multiscale modeling of tumor growth induced by circadian rhythm disruption in epithelial tissue // J. Biol. Phys. - 2016. - Vol. 42, № 1. - P. 107-132.
  2. Захаров А.П., Брацун Д.А. Синхронизации циркадианных ритмов в масштабах гена, клетки и всего организма // Компьютерные исследования и моделирование. - 2013. - Т. 5, № 2. - С. 255-270.
  3. Брацун Д.А., Захаров А.П., Письмен Л.М. Многоуровневое математическое моделирование возникновения и роста опухоли в ткани эпителия // Компьютерные исследования и моделирование. - 2014. - Т. 6, № 4. - С. 585-604.
  4. Брацун Д.А., Захаров А.П. Математическое моделирование раковых образований при коллективном взаимодействии клеток эпителия // Вест. Перм. гос. гум.-пед. ун-та. Сер. № 2: Физико- математические и естественные науки. - 2014. - Вып. 1. - С. 20-34.
  5. Bratsun D., Volfson D., Hasty J., Tsimring L. Delay-induced stochastic oscillations in gene regulation // PNAS. - 2005. - Vol. 102, № 41. - P. 14593-14598.
  6. Брацун Д.А., Захаров А.П. Моделирование пространственно-временной динамики циркадианных ритмов Neurospora crassa // Компьютерные исследования и моделирование. - 2011. - Т. 3, № 2. - С. 191-213.
  7. Bratsun D.A., Zakharov A.P. Spatial Effects of Delay-Induced Stochastic Oscillations in a Multi-scale Cellular System // Springer Proceedings in Complexity. - 2016. - P. 93-103.
  8. Bratsun D.A., Zakharov A.P., Pismen L.M. Chemo-mechanical modeling of Tumor Growth in Elastic Epithelial Tissue // AIP Conference Proceedings. - 2016. - Vol. 1760. - 020007.
  9. Брацун Д.А., Захаров А.П. Пространственно-распределенные стохастические колебания с запаздыванием в многоклеточной системе // Вест. Перм. гос. гум.-пед. ун-та. Сер. № 2: Физико- математические и естественные науки. - 2015. - Вып. 1. - С. 73-87.
  10. Zakharov A.P., Pismen L.M. Reshaping nemato-elastic sheets // Eur. Phys. J. E Soft Matter. - 2015. - Vol. 38, № 7. - P. 75.
  11. Martinez-Torres C., Laperrousaz B., Berguiga L., Boyer-Provera E., Elezgaray J., Nicolini F.E., Maguer- Satta V., Arneodo A., Argoul F. Deciphering the internal complexity of living cells with quantitative phase microscopy: a multiscale approach // J. Biomed. Opt. - 2015. - Vol. 20, № 9. - P. 096005.
  12. Брацун Д.А., Красняков И.В. Математическое моделирование процесса терапии раковой опухоли с помощью наночастиц // Математическое моделирование в естественных науках: тез. докл. - Пермь: изд-во ПНИПУ, 2016 - С. 53-54.

Загрузки

Опубликован

2017-09-04

Выпуск

Раздел

Исследования: теория и эксперимент

Как цитировать

Брацун, Д., Захаров, А., Красняков, И., Люшнин, А., & Меркурьев, Д. (2017). Моделирование возникновения и роста раковых образований при коллективном взаимодействии клеток живой ткани,обменивающихся химическими и механическими сигналами. Вестник Пермского федерального исследовательского центра, 1, 20-26. https://journal.permsc.ru/index.php/pscj/article/view/PSCJ2017n1p3